В музей можно попасть через южные ворота Зала 100 Колон. Он содержит не только то, что найдено в Персеполе; к примеру, в правых галереях есть экспозиция доисторической глиняной посуды и экспонаты из соседних областей, включая Таль-э-Бакум, а в галереях с левой стороны представлены ранние исламские экспонаты из Истахра. На выходе из Музея, если резко повернуть направо и следовать в направлении внешней стены, попадаешь к небольшим, покрытым несколькими барельефами дверям. На этой стене находится две группы плиток эпохи Ахменидов, рисунок на которых сегодня едва различим, а когда-то они были окрашены в яркие цвета. Весь дворец был также покрыт цветными плитками или раскрашен, однако эта роспись до наших дней не сохранилась.